Tên chi Dendrogramma bắt nguồn từ hai từ tiếng Hy Lạp cổ đại δένδρον (déndron), có nghĩa là "cây", và γράμμα (grámma), có nghĩa là "hình vẽ, hình toán học".[5][6] Nó ám chỉ đến mô hình phân nhánh của các ống tiêu hóa, nhìn giống như một biểu đồ sinh học, tức là sơ đồ phân nhánh thường được các nhà sinh vật học sử dụng để minh họa mối quan hệ tiến hóa giữa các sinh vật.

Tên cụ thể enigmatica (enigmatic nghĩa là "bí ẩn" trong tiếng Anh) đề cập đến bản chất bí ẩn của loài sinh vật này, trong khi discoides - tên của loài thứ hai - ám chỉ đến hình dạng giống đĩa của nó.[7]